1、税务抽查，税务机关每年都要按一定比例抽样检查一小部分公司的账目，抽样检查一般分为定向抽样检查和不定向抽样检查。定向抽样检查通常根据税务稽查对象类型、企业规模、收入规模、纳税数额、成本利润率、税负率、税收风险等级、纳税信用级别等特定条件，不定向抽样检查不设定条件，通过摇号确定待查对象名单。

　　2、根据风险管理流程推送的高风险纳税人风险信息分析选取的抽样检查对象，另外就是上一级税务机关安排的抽样检查计划和打击偷税、逃避追缴欠税、骗税、抗税、虚开等稽查任务。

　　3、公司被人举报了，假如你公司偷漏税别人举报了，公司就会被税务稽查，公司存有经营不规范、做假账，或有偷漏税嫌疑，如果被相关的人员掌握了信息并向税务机关实名举报，证据比较充分、事实也比较清楚的话，那么税务稽查就会对公司进行立案调查。

　　4、有很多企业被税务稽查是因为虚开，金税三期上线后，别再相信虚开一两张发票不会被查，税务机关运用大数据，即使你虚开一张发票就会被查。如果你虚开的发票上游企业被查，那么你也会跟着被查。如果企业发票的进项与销项不一致，就有虚开的嫌疑。

　　5、有一些企业为了虚增费用，虚列工人工资，尤其是一些小企业，把一些亲戚朋友的身份证录入自己公司虚列工资。新的个税申报系统上线后，公司再这样虚列工资，小心被税务机关预警。

　　6、未开票收入不申报，一定要及时的进行纳税申报缴纳税款。公司应该以增值税纳税义务发生的时间确认实际收入并申报纳税，纳税人未按照规定期限缴纳税款的，扣缴义务人未按照规定期限解缴税款的，税务机关除责令限期缴纳外，从滞纳税款之日起，按日加收滞纳税款万分之五的滞纳金。